Detecção e caracterização molecular do Apple Stem Grooving Virus em pereiras no Sul do Brasil
Palabras clave:
fitossanitário, sequenciamento de alto rendimento, Capillovirus mali.Resumen
A cultura da pereira (Pyrus communis L.) apresenta elevado potencial produtivo na região Sul do Brasil, mas é vulnerável a diversas viroses que afetam sua qualidade e rendimento. Este estudo teve como objetivo detectar e caracterizar molecularmente o Apple Stem Grooving Virus (ASGV) em amostras de pereira coletadas no município de São Joaquim, Santa Catarina. Três amostras de cultivares copa foram submetidas ao sequenciamento de alto rendimento (HTS), resultando em aproximadamente 41 milhões de leituras, posteriormente filtradas, montadas e analisadas com ferramentas bioinformáticas. Para validação dos dados obtidos por HTS, foi realizada a amplificação por PCR com primers específicos para ASGV, confirmando a presença do vírus em uma das amostras, com visualização dos produtos por eletroforese em gel de agarose. O genoma completo do isolado viral identificado apresentou 6.476 nucleotídeos e revelou duas ORFs características: a primeira codificando uma poliproteína relacionada à replicação viral, e a segunda, a proteína de movimento. As análises de similaridade com sequências depositadas no GenBank indicaram elevados níveis de identidade nucleotídica, sendo 87,94% para a poliproteína e 95,62% para a proteína de movimento. Os resultados demonstram a eficácia da integração entre métodos moleculares convencionais e tecnologias de nova geração na identificação e caracterização de vírus vegetais, além de contribuírem para o conhecimento da diversidade viral em pomares de pereira e para o aprimoramento das estratégias de monitoramento fitossanitário na região.
Citas
AGRIOS, G. N. Plant Pathology. 5. ed. San Diego: Academic Press, 2024.
ARAUJO, L. et al. Doenças da macieira e da pereira. Informe Agropecuário, v. 37, p. 61-74, 2016.
CARRA, B. et al. Plant growth regulators to increase fruit set and yield of ‘Rocha’ pear trees in Southern Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 93, n. 3, p. 1-16, 2021.
COSTA, L. C. et al. High-throughput detection of a large set of viruses and viroids of pome and stone fruit trees by multiplex PCR-based amplicon sequencing. Frontiers in Plant Science, v. 13, 12 dez. 2022.
FERRADINI, N. et al. Characterization and phylogenetic analysis of ancient Italian landraces of pear. Frontiers in Plant Science, v. 8, p. 751, 9 maio 2017.
GERUM, A. F. A. A. et al. Fruticultura tropical: potenciais riscos e seus impactos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2019. (Embrapa Mandioca e Friticultura. Documentos, 232).
IBGE. Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística. Produção de Maçã. 2023.
ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. 2025. Disponível em: https://ictv.global/taxonomy
LOPES, C.A.; ÁVILA, A.C. Doenças do tomateiro. 2. ed. Brasília: Embrapa, v. 1, p. 151, 2005.
NICKEL, O. et al. Sequence analysis of the capsid protein gene of an isolate of apple stem grooving virus, and its survey in southern Brazil. Fitopatologia Brasileira, v. 26, p. 655–659, 2001.
NICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Eliminação de vírus latentes de macieiras por quimioterapia e cultivo de meristemas in vitro. Bento Gonçalves, RS: Embrapa Uva e Vinho, 2016. 36 p. (Embrapa Uva e Vinho. Comunicado Técnico, 193).
VILLAMOR, D. E. V. et al. High throughput sequencing for plant virus detection and discovery. Phytopathology, v. 109, n. 5, p. 716–725, maio 2019.
WU, J. et al. High-density genetic linkage map construction and identification of fruit-related QTLs in pear using SNP and SSR markers. Journal of Experimental Botany, v. 65, n. 20, p. 5771–5781, nov. 2014.
